主要区别是新区多数有一级行政管理权，开发区一般没有。

其他区别：

国家级新区规格是副部级，而开发区的级别达不到；地位不同，国家级新区的成立乃至于开发建设都上升到国家战略，开发区有不具备国家战略特征；国家级新区由国务院统一进行规划和审核，开发区一般由地方省市规划后，报国务院批准；数量上，国家开发区的数量也远远多于国家级新区：发展定位：国家级新区都有明确的发展定位，新区是国家综合配套改革试验区，是统筹城乡综合配套改革试验的先行区；新区承担着更多综合性的功能，为城市发展扩展空间。

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